Admirat de milioane de oameni pentru talentul său de a dresa câinii, Cesar Millan a provocat un adevărat scandal după ce a recunoscut într-o emisiune – AlanTitchmarsh Show – că uneori loveşte câinii sau foloseşte zgărzi cu şocuri electrice pentru a rezolva cazurile dificile. Cu toate că ainsistat că astfel de măsuri sunt necesare şi aplicate când are de-a face cu câini foarte agresivi, la care nu funcţionează metodele de dresaj tradiţionale, asociaţiile pentru protecţia animalelor nu au fost satisfăcute de explicaţiile primite.
Declaraţiile lui Cesar Millan au stârnit indignare pe internet, nu puţini fiind cei care i-au criticat metodele, acuzându-l de cruzime faţă de animale. De asemenea, s-a spus că Millan pretinde aproape 100.000 de dolari pentru a educa animalele vedetelor de la Hollywood.